MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015850	GGC	2	6	271568	271573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781000
5502	NC_015850	TTC	2	6	271616	271621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781000
5503	NC_015850	ATG	2	6	271701	271706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781000
5504	NC_015850	CGA	2	6	271780	271785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781000
5505	NC_015850	TGG	2	6	271792	271797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781000
5506	NC_015850	TGG	2	6	271819	271824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781000
5507	NC_015850	CTC	2	6	271856	271861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781000
5508	NC_015850	GCTG	2	8	271930	271937	0 %	25 %	50 %	25 %	340781000
5509	NC_015850	CGGC	2	8	271938	271945	0 %	0 %	50 %	50 %	340781000
5510	NC_015850	AGC	2	6	271946	271951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781000
5511	NC_015850	TCG	2	6	271974	271979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781000
5512	NC_015850	CGC	2	6	271984	271989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781000
5513	NC_015850	CCG	2	6	272004	272009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781000
5514	NC_015850	CCGC	2	8	272023	272030	0 %	0 %	25 %	75 %	340781000
5515	NC_015850	CCA	2	6	272053	272058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781000
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5517	NC_015850	CG	4	8	272118	272125	0 %	0 %	50 %	50 %	340781000
5518	NC_015850	AGC	2	6	272187	272192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781000
5519	NC_015850	GGCG	2	8	272251	272258	0 %	0 %	75 %	25 %	340781000
5520	NC_015850	CGC	2	6	272326	272331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781000
5521	NC_015850	GCC	2	6	272418	272423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781000
5522	NC_015850	GCTG	2	8	272426	272433	0 %	25 %	50 %	25 %	340781000
5523	NC_015850	TCG	2	6	272466	272471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781000
5524	NC_015850	TTG	2	6	272483	272488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781000
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5526	NC_015850	CGG	2	6	272611	272616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781000
5527	NC_015850	CTTC	2	8	272617	272624	0 %	50 %	0 %	50 %	340781000
5528	NC_015850	CA	3	6	272627	272632	50 %	0 %	0 %	50 %	340781000
5529	NC_015850	GGAG	2	8	272673	272680	25 %	0 %	75 %	0 %	340781000
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5534	NC_015850	CAG	2	6	272888	272893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781000
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5538	NC_015850	GAT	2	6	273131	273136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781000
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5540	NC_015850	GGCG	2	8	273203	273210	0 %	0 %	75 %	25 %	340781000
5541	NC_015850	TCC	2	6	273273	273278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781000
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5543	NC_015850	TCA	2	6	273298	273303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781000
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5545	NC_015850	TGCCGG	2	12	273394	273405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781000
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5549	NC_015850	GCA	2	6	273513	273518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781001
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5551	NC_015850	GC	3	6	273598	273603	0 %	0 %	50 %	50 %	340781001
5552	NC_015850	GCT	2	6	273628	273633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781001
5553	NC_015850	GCA	2	6	273675	273680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781001
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5556	NC_015850	AGCC	2	8	273887	273894	25 %	0 %	25 %	50 %	340781001
5557	NC_015850	GCA	2	6	273945	273950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781001
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5564	NC_015850	CGG	3	9	274218	274226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781001
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5578	NC_015850	GTCGC	2	10	274834	274843	0 %	20 %	40 %	40 %	340781001
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5621	NC_015850	GTC	2	6	276634	276639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781001
5622	NC_015850	A	6	6	276683	276688	100 %	0 %	0 %	0 %	340781001
5623	NC_015850	CGGG	2	8	276689	276696	0 %	0 %	75 %	25 %	340781001
5624	NC_015850	TCC	2	6	276791	276796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781001
5625	NC_015850	GGC	2	6	276803	276808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781001
5626	NC_015850	TCC	2	6	276851	276856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781001
5627	NC_015850	GCA	2	6	276870	276875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781001
5628	NC_015850	ACG	2	6	276878	276883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781001
5629	NC_015850	CCGGG	2	10	276884	276893	0 %	0 %	60 %	40 %	340781001
5630	NC_015850	GAG	2	6	276930	276935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781002
5631	NC_015850	CCA	2	6	276947	276952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781002
5632	NC_015850	CG	4	8	276976	276983	0 %	0 %	50 %	50 %	340781002
5633	NC_015850	CGT	2	6	276989	276994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781002
5634	NC_015850	GCC	3	9	277027	277035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781002
5635	NC_015850	GC	3	6	277071	277076	0 %	0 %	50 %	50 %	340781002
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5637	NC_015850	CGG	2	6	277155	277160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781002
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5639	NC_015850	TG	4	8	277211	277218	0 %	50 %	50 %	0 %	340781002
5640	NC_015850	AGG	2	6	277266	277271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781002
5641	NC_015850	TTCCCA	2	12	277308	277319	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340781002
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5643	NC_015850	GA	3	6	277416	277421	50 %	0 %	50 %	0 %	340781002
5644	NC_015850	GAG	2	6	277467	277472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781002
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5651	NC_015850	ACC	2	6	277860	277865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781003
5652	NC_015850	AAG	2	6	277887	277892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781003
5653	NC_015850	CGT	2	6	277900	277905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781003
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5662	NC_015850	GCG	2	6	278420	278425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781003
5663	NC_015850	GCAGC	2	10	278458	278467	20 %	0 %	40 %	40 %	340781003
5664	NC_015850	TGT	2	6	278500	278505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781004
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5669	NC_015850	TGG	3	9	278671	278679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781004
5670	NC_015850	CGC	2	6	278681	278686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781004
5671	NC_015850	TCC	2	6	278789	278794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5672	NC_015850	GCC	2	6	278890	278895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781005
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5681	NC_015850	GCC	2	6	279221	279226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5682	NC_015850	TCT	2	6	279248	279253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781006
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5707	NC_015850	TGA	2	6	280437	280442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781006
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5712	NC_015850	CTT	2	6	280654	280659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781007
5713	NC_015850	GC	4	8	280751	280758	0 %	0 %	50 %	50 %	340781007
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5720	NC_015850	TGGCAA	2	12	281083	281094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781008
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5723	NC_015850	GCA	2	6	281380	281385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5724	NC_015850	CTG	2	6	281438	281443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5725	NC_015850	GCC	2	6	281451	281456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781008
5726	NC_015850	GCAGGC	2	12	281506	281517	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781008
5727	NC_015850	GCT	2	6	281548	281553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5728	NC_015850	GCC	2	6	281664	281669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781008
5729	NC_015850	TGA	2	6	281815	281820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781008
5730	NC_015850	GCA	2	6	281857	281862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5731	NC_015850	CGT	2	6	281941	281946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5732	NC_015850	GCG	2	6	282027	282032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781008
5733	NC_015850	GGC	2	6	282043	282048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781008
5734	NC_015850	GC	3	6	282047	282052	0 %	0 %	50 %	50 %	340781008
5735	NC_015850	GCGA	2	8	282083	282090	25 %	0 %	50 %	25 %	340781008
5736	NC_015850	TGG	2	6	282100	282105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781008
5737	NC_015850	AGCG	2	8	282121	282128	25 %	0 %	50 %	25 %	340781008
5738	NC_015850	CTG	2	6	282155	282160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5739	NC_015850	GCA	2	6	282187	282192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5740	NC_015850	GCT	2	6	282233	282238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5741	NC_015850	CTC	2	6	282293	282298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781008
5742	NC_015850	GCAATG	2	12	282309	282320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781008
5743	NC_015850	ACCAGC	2	12	282336	282347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340781008
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5865	NC_015850	CCT	2	6	287489	287494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781015
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5868	NC_015850	TCA	2	6	287561	287566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781015
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5872	NC_015850	TCGATG	2	12	287758	287769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781015
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5883	NC_015850	GCA	3	9	288131	288139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781015
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5980	NC_015850	CAT	2	6	292370	292375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781019
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5984	NC_015850	GCC	2	6	292594	292599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781019
5985	NC_015850	CTG	2	6	292640	292645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781019
5986	NC_015850	GGT	2	6	292673	292678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781019
5987	NC_015850	CCA	2	6	292699	292704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781019
5988	NC_015850	GCG	2	6	292712	292717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781019
5989	NC_015850	CCTG	2	8	292766	292773	0 %	25 %	25 %	50 %	340781020
5990	NC_015850	CCG	2	6	292795	292800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781020
5991	NC_015850	GGCC	2	8	292831	292838	0 %	0 %	50 %	50 %	340781020
5992	NC_015850	AGACCG	2	12	292924	292935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781020
5993	NC_015850	GCC	2	6	292943	292948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781020
5994	NC_015850	G	6	6	293018	293023	0 %	0 %	100 %	0 %	340781020
5995	NC_015850	AGGG	2	8	293110	293117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_015850	CGG	2	6	293124	293129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5997	NC_015850	GCC	2	6	293135	293140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5998	NC_015850	CGG	2	6	293181	293186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781021
5999	NC_015850	GC	3	6	293191	293196	0 %	0 %	50 %	50 %	340781021
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